酶基因的克隆与
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山东农业科学
Sadn gch r c ne hn ogA r u ua Si cs i l e
20 05年第 2期
番茄果实蔗糖磷酸合成酶基因的克隆与序列分析孙丽萍-王秀峰杨建平于明礼于喜艳H,,,,(. 1山东农业大学园艺科学与工程学院,山东泰安 2 11;.州职业学院, 7082滨山东滨州 262 ) 564
摘
要:据 G n ak已登记的番茄、根 eBn中马铃薯等蔗糖磷酸合成酶基因的保守序列设计特异引物,用采
R—e T P R方法,番茄自交系 2—l果实总 R A中克隆到目的基因的全长 cN。序列分析表明,与 G n从 o 9 N DA它 e-
Bn ak中登记号为 A 0 11 B526的番茄蔗糖磷酸合成酶基因高度同源,核苷酸序列的同源性为 9%。该基因已在 8Gn ak中注册,记号为 A 763。 eB n登 Y 249
关键词:番茄;T— C; R P R蔗糖磷酸合成酶;克隆;序列分析中圈分类号:7;612 Q 8¥4 .文献标识号: A文章编号: 0— 9220 )2 OO o 1 1 44 (050一 O8一 4 0
Cl n n n e u n i g o ma o fu ts c 0 e o i g a d s q e cn fTo t r i u r s1h0 pl t y姐口 s ̄ es n II 一 一,
S e e g ne一
S N i ig W ANG u— fn z YANG Ja U L—p n I Xi eg in—pn‘ ig,YU Mig—l, U—yh n i Y Xi a‘,
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g n s rgs
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s ta ee.hs ac s u brs B 526 l eehdbe g t di G n ak neac8 nm e yhs gn w oe ce m e i A 0 11 .nign a enr s r eBn . l ce8 u br n e s n s e e n i e i A 2 4 9. s Y7 6 3 Ke r s T mao y wo d o t,RT— P R,S coe P op ae S nh e lnn e u rs h sh t y ta,C o ig,S u n ig s q e e cn
蔗糖磷酸合成酶 (ur e popa n a, se 6— h ht s t e o s e yh s
s s是调控植物碳同化和分配的关键酶之一, P)催化果糖和尿苷二磷酸葡萄糖形成蔗糖和尿苷二磷酸。S S活性的高低, P影响蔗糖的合成能力和光合同化的碳在淀粉和蔗糖之间的分配【。目前, l】 对于绿色光合组织中 S S的研究已经很深人, P但
1材料与方法供试番茄为番茄自交系 2 0—1; N e 9 R APR( M ) e . Ktp C A V V r 1 i U m—TV c r T N连 2, et和 4D A o
接酶购自上海博亚生物技术有限公司;a a aL T K R ATq am,
G l N r m n R cvr Kt自 e D A Fa et e e i购 g o y
对于其在非光合组织,如鳞茎和果实中的作用研究则较少。在番茄中,P S S不仅调控叶片的碳代谢,而且对于果实竞争同化物的能力,实的糖分果组成及含量具有重要的调节作用【。为了充分 2“】了解 S S的结构及其在番茄果实的产量形成和品 P质方面的作用,很有必要对其基因进行克隆,为 S S因的开发利用工作奠定基础。
P基
大连宝生物工程有限公司;大肠杆菌 Dia由山 t S 东农业大学生命科学学院提供。 取转色期的番茄果实提取总 R A, N提取方法参照文献【。根据 G n ak中登记的番茄、 5】 e Bn马铃薯等 SS基因的保守序列设计上游引物为 5一 P’G A A G C G A A G T一3和下游引物为 G G TG G GA T A’5一T T C T A C G A T T’ C C A G A C G AC G C一3。按’ R A N
收稿日期:O4 2 2 2O—1— 2作者简介:孙丽萍(95。。 1一)女硕士研究生。 7主要从事生物技术与蔬菜育种研究。 *通讯作者: m i qkn@sa. uc E— a: gog due .n l d8
酶基因的克隆与
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P R A V V r. Kt剂盒说明书进行逆转录: c ( M ) e 1 i试 2
采用扩增效率高和保真性好的 TK R A Tq, a a aL aT M结果扩增出一条特异性较强的目的带,用普通而
取 1 l约 lg番茄果实总 R A于 85 ( t) t N .t菌双蒸 d无水中,2 7℃水浴 1rn立即置冰上 2 i,人 0 i, a mn后加1× RNA C fe/, 2 0 P R Bu r 2A 5 mmo/ CI 4d, l L Mg 2 t
Tq则没有扩增出带。扩增产物经 I%谅 a时, . 0脂糖凝胶电泳检查,在约 3 3b处有一条带, .l【片段大小与预期的一致( 2。图 )l 2
1m o Ld T , ee eTasr t e( U ) 0 m l N P2 R vr r c p/ s n i ̄ 5/ 1l R a n i t .t , N s I bo 05 e h ir a和 Oi ( T lo d )一A at g dp r o
P m rll置于 P R仪中,应条件为 4 r e t。 i t C反 2【 c=3 rn 9℃ 5 i,℃ 5 i。逆转录反应完成后, 0 i, a 9 mn 5 mn 向反应体系中加入下列成分: a a aL aT TKR ATq M(U t ) .t,0×L C u e 1( p s 5/ 10d 1 d A P R Bf r I M l) u
4 3
l,t o L上游引物 6, p o L下游引物 0 4 ml t/ t 4 ml d/
6 l灭菌双蒸水 5 t。总体积为 10。P R反 I, t 7 d 0t C d应参数为 9℃预变性 5 i,
4 m n随后 9℃ l i,2【 4 mn 6 c=1 i。2 4 i,2个循环后,2 mn 7℃ rn 3 a 7℃再延伸 1mn 0 i。目的片断的回收按 A a s e D A Fam n gr e l N r et o G g
●I 6 1 b p -l 2 3 4 5
1一HidⅢ D A Ma r 2果实总 R A的 R . n N  ̄e . N T—P R产物 C
图 2番茄果实 SS因 R P R产物 P基 T— C
23 T—P R产物的克隆 . R C
R cvr Kt明书进行。 P R产物纯化后, eoey说 i G直接与 pC U m—TV c r et连接,用热激法转化大肠杆 o采菌D S H a感受态细胞。感受态细胞的制备采用 C C法【。取 2 0 1液涂布于含 x—g aI 6 2】 0 ̄菌 a 1和
R—P R产物纯化后, T C直接与 p C U m—TV c e. t连接,化大肠杆菌 D S,白斑筛选获得 o r转 Ha蓝26个白斑。随机挑取 4个克隆提取质粒, C 1 PR结果显示均为阳性 ( 3,表明 R图 )这 T—P R的产 C
物已克隆到载体上
Ir P G的筛选培养基 ( A p平板上,7培养含 m) 3℃ 1h, 6后随机挑取 4个白色菌落,别接种于加有分 A p5 m/ m 0 g L的 L B液体培养基中,7 3℃培养过夜。 按碱裂解法少量提取质粒。以质粒 D A为模板 N进行 P R鉴定, C委托上海博亚生物技术有限公司测定 D A序列。 N
2结果与分析2 1 R A的提取 . N
13 4 5为电绳予的 P RJ… C 物 2为—Hi 1 D  ̄e n I NA Ma r d 1
—图 3重组质粒 P R鉴定 C
图 l所提 R A的电泳结果。从中可以看是 N
24 SS基因 e N . P D A的序列分析
出所提 R A完整性很好,降解。经紫外分光光 N无度计测定, D, O 2=20,到了 R O ./ D8 ̄ o 0 .1达 T—P R C对 R A的要求 Nl 2
将所得目的克隆的重组质粒纯化后进行序列
测定,结果如图 4图 5、。测序结果表明,所克隆的eN D A长 37b, 33 p编码区序列长 36b, 12 p编码 15 04
个氨基酸。与 G n ak中的同源序列相比较, eB n本研究所分离的 c N D A与序列号
为 A 0 11 B 526的番
一1番茄 2 . o一1 N ( O3t 2番茄 2—1 N ( 0 5 ) 9R A约 . g t) . 0 9R A约 . m
茄 SS基因核苷酸序列的同源性为 9%,明该 P 8说 eN D A为番茄果实 SS基因 e N在 G n ak中 P D A。 eBn的登记号为 A 76 3。 Y 24 9
3结论与讨论3 1番茄果实 SS基因序列在品种间存在差异 . P
圈 1番茄果实总 R A N
本实验是参考番茄、马铃薯等 S S基因的保 P守序列,设计引物,克隆番茄果实 SS基因的。结 P果发现,从番茄自交系 2一l 0 9中得到的果实 SS P基因序列与来自其它品种番茄的 SS基因序列存 I在一定的差异。基因的eN本 D A核苷酸序列与9
22 S s基因的 R . P T—P R扩增 C
以番茄果实总 R A为模板,行 R N进 T—P R C扩增。由于考虑到所扩增片段较长 (于 3 b。大 k )而普通 Tq最适的扩增范围在 2b之内, a k本实验
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G T C A A A G A: C G GT C A GA A G^ A lG C C A A T T T A C G GC C A CT I G A C GC G G G A T CI G T G G A A G G AC TGGAGG^TIr’CGA^TI CC GCC C GGAAAAAGCAGCTr GAGGGAGAGC GC从 TCGGT G GAT CGC AAAACGCCI: CAAG从 CGT GAGAGAGGTC GCAGAGAAGCAGTr GCTG^T ATG TC
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C G r A C A A( 33 G T C T G G 37 )
圈 4番茄果实 S s基因 c N P D A序列1 0
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MA D N Y E ID G G D K s I It R R GN S L AL V P L D K s J E G F m Y v E 下) L R RA A R P E N R E MC聊NI R K E Q WMA J FE V 1m HS Q T SQ R T L N砷^R K QL GE AR
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图 5番茄果实 S S基因推导的氦基酸序列 I
G n ak中的登记号为 A 0 1 1 e Bn B 52 6的番茄 S S因 P基的同源性为 9%,登记号为 A 0 18番茄 8与 F 77 6的
糖的输出库变大…。通常,光合组织如鳞茎和非果实中,P S S的活性较低。但越来越多的实验表
S S因的同源性为 9%, P基 7其差异应该是由于品种不同而造成的。32番茄果实 S S基因全长 c N . P D A的获得高质量的 m N R A是获得全长 c N D A的前提,
明,P SS在非光合组织中也具有重要作用, P S S的活性有潜在的对发育过程中如开花、果和源一结库关系的影响,已被一些 SS正义转化植株的这 P表现所证实。S S P活性的高低还影响果实的糖分
以不完整的 m N R A为模板,只能反转录成短切的 eN D A
片段。本实验采用异硫氰酸胍一苯酚一氯仿一步法分离纯化 R A将变性和抽提两个步骤 N,并人一个操作中,很大程度上简化了实验程序,在 避免了烦琐操作所可能引起的 R ae降解及污 Ns的染,结果所提 R A质量很高。在反转录以后的 NP R扩增时,初我们采用的 D A聚合酶是普通 C最 NTq做了一段时间始终没有扩增出来,来考虑 a,后到目的片段较长, 30 b为 30 p左右,而普通 Tq最 a
组成和积累。在番茄、瓜和香蕉等果实的成熟香过程中,蔗糖的积累与 SS活性之间有直接的关 P系,但其机理并不清楚[ 9。目前,于果实 SS 7】 -对 P的研究较少。为了检测番茄果实成熟过程中 S S P基因的表达规律及番茄果实 SS基因正义转化株 P的性状表现,我们克隆了本基因,为以后的工作奠定了基础。参考文献:
适扩范在0b内因改扩效 …的增围 2 p,此用增率 0艺 0高和保真性好的 TK R A a a aL 瑚结果只扩增了次,扩增出特异性很强的目的带,明便说一
y毗 H 。’ ==,.
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ioe eea t von t . ua fxr ea nlr asn a rdepe… Jrl E e n d lv dl seiln e on pi t o m l . Ba,0,4 8: 1—8 on 2 35(9 13 1 0 ty 0 3 ) 8 2
L M长段增面实有 A在片扩方确具优 T势。本实验没有采用常用的 R C A E方法克隆全长
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8 i—hp ̄sts J Pn,9。3 5— 9 U ̄ p s yhe] lt 172: 3 2 . C6 oh na[ .aa 9 0 2 5 C
而获得了成功,说明在获得高质量的 R A的前提 N
CⅨh y -u ̄ aite,?,凹毗 3 n e Q o,Hycnh TbF c, 0] n Ndoo H y
下,化验优实体系,接基因上和游的直根据的游下保守序列,设计特异引物,扩增全长 e N D A有时是可行的,如果辅以措施,消除 m N R A中可能有的特
liirfo蜘[ . Eee 0二 ao d ag t n d n n t s t]J af p t 伽 l rn o i a lBa 9 0 3: 5 7 . on 1 95( 5 7—9 ty 9 3)8 1 oefr
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,
.
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殊二级结构的影响,消除在逆转录过程中对I N n A R模板的降解,则成功的可能性会更大。33 SS的功能研究 . P
… .uao x r。 Ba,01 2 5 8—8. Jrl E e on 2。 ( 8 8 8 on pi f ty 0 5 3 ) 1 9 C赵宜,耀荣 绍一种新的R A 5双吴 3介 N提取方法[ J遗传,][ 6] 3 3.克 3 8弗里奇 3 7-
,
E F.
.
,
T曼尼阿蒂斯 .子克隆指 .分
SS P催化果糖和尿苷二磷酸葡萄糖形成蔗糖
南[]金科黎 M .雁,盂枫译 .北京:科学出版社。 9,一 1 25 9 5
和尿苷二磷酸,是调节植物碳水化合物代谢的关
,‘、
.
键之。 S性适增,对株体酶一 S活的当强可植总 P的碳同化产生积极的影响。SS主要是在叶片中 P促进蔗糖的形成,活性高低与叶片的光合速率其有定的相关性。C al发现,入玉米 SS基 hr s e转 P一
j: h:[ 8 NL。
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c8auut mors]P th i,9。94. mec mlnt a i J l yo 1 2 9:4 c a go tft . a P ̄i 9 i u[ n 3H es,Ir .一lp ts. r P r M s b c I aD p l。y Ih n t88 . v ade in 0。一 l enad e Bemn协 f 眦i j 1 dcj t且。 a n o
因的烟草与对照相比:同叶龄的叶片中 SS活不 P性均比对应的对照叶片中的高,其是幼叶和老尤叶中活性显著增高,幼叶和老叶的光合性能增强,
d epg u ml (u m e L)J. lth i eli s enC uiml .[ P yd von m k o c s o ] a P ̄ n[ 9]。 ni 8B R。L _0FM。 a.B I . 丑o l毗 1 a一
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老叶的衰老被延缓,功能叶中蔗糖的合成增加,蔗
【 lt 17 0:3 2 J Pn 9 3 8— 8]
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