紫外光谱 应用
2010年38卷第5期广州化工
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紫外光谱在研究金属配合物与DNA相互作用中的应用
高婷1,张万举1,王芳2,张海滨1,张伟1
(1黄冈师范学院化学与应用化学学院,湖北黄冈438000;
2黄冈师范学院计算机科学与技术学院,湖北黄冈438000)
摘
要:概述了紫外光谱法在研究金属配合物与DNA相互作用中的应用。紫外光谱法是一种研究配合物与DNA相互作用最
简便、常用而有效的方法,不仅能够判断配合物与DNA间的作用模式,还能够准确表征两者间的作用强度,在化合物与DNA相互作用研究中发挥着重要作用。
关键词:紫外光谱;配合物;DNA相互作用
ApplicationofUVSpectraintheInteractionofDNAand
GAOTin91,ZHANG
MetalComplexes
Weil
4
Wan一豇1,WANG
Fanf,ZHANGHai—binl,ZHANG
Normal
(1SchoolofChemistryandAppliedChemistry,HuanggangNormalUniversity,HubeiHuanggang438000;
University,HubeiHuanggang
2SchoolofComputerScienceandTechnology,Huanggang438000,China)
Abstract:The印plicationoftheUVspectraintheinteractionofDNAandmetalcomplexwassummarized.TheUV
can
spectrawasthemostcommonmeanstoexaminetheinteractionbetweenmetalcomplexandDNA.It
not
only
judge
the
bindingmodeofthecomplexandDNA,butalsoevaluatethebindingstrengthofthemquantitatively.
Keywords:UV;complex;DNA—binding
DNA是药物设计的重要靶点,金属配合物与DNA相互作用研究可以为抗癌金属配合物的发现和优化提供理论指导,同时金属配合物还可以作为DNA的手性探针和光探针,对探索DNA尤其是病变DNA的结构和遗传信息具有重要的应用价值。目前,对于金属配合物与DNA相互作用的研究方法有很多,其中紫外光谱法是一种最常用和有效的方法。1
1.1
受损而影响其功能。
1.2影响配合物与DNA相互作用的因素
配合物与DNA的键合模式与配合物的形状、大小密切相关,并因此影响到其与DNA的结合力大小。(1)配合物的形状:配合物的形状结构与底物(DNA)匹配程度决定了配合物与DNA的结合模式。(2)插入基团的平面性及大小:能够与DNA以较强插入模式相结合的配合物,其插入基团要有较好的平面性和适中的平面面积。一般来说,插入基团的平面面积与插入强度成正比,但是当增大的面积与插入基团不在同一平面内而使空间位阻增大时,化合物与DNA的作用反而减弱u。2J。(3)取代基的差异:当化合物插入DNA时,取代基空间位阻过大就会减弱这种作用。虽然大的取代基不利于插入剂与DNA相互作用的动力学因素,但却有利于其与DNA碱基之间的堆积作用。同一取代基,占据不同的位置时,生物活性不一样,而且取代基不同,药物的生物活性也会发生很大的变化一J。2
金属配合物与DNA相互作用概述
金属配合物与DNA的作用方式
金属配合物与DNA的作用方式可分为非共价结合、共价结
合和剪切作用等。其中非共价结合虽然作用力较弱,但其在分子水平的生命现象中却是一种决定性的因素,形成了核酸生物功能所需要的空间结构。它们的结合的程度和方式与具体的环境条件有关,主要包括三种不同的方式:静电结合、沟槽结合和插入结合。静电结合是指小分子利用所带的正电荷与带负电荷的DNA分子的磷酸骨架之间通过非特异性静电作用的结合,一般来说,静电结合没有选择性,又因为作用于磷酸骨架,在药物开发应用价值上不大;沟槽结合是小分子与核酸的大沟或小沟的碱基对边缘直接作用,作用形式主要是氢键和范德华力;插入结合是小分子利用其平面或几乎平面的芳香环[如邻菲哕啉(phen)、菲醌二亚胺(phi)、二吡啶吩嗪(dppz)]插入DNA碱基对之间,是药物分子与DNA间发生作用的最重要的形式之一。当DNA靶向分子嵌入DNA碱基对之间后,有的可以直接抑制DNA的复制与转录;有的则在经过进一步活化后,使DNA断裂
4基金项目:黄冈师范学院青年科研基金(09CDl57)。
紫外光谱在研究配合物与DNA相互作用中的应用
配合物与DNA相互作用的研究方法主要有光谱法、流体力学方法、电化学方法、NMR等,其中光谱法中的紫外光谱法是研究小分子与核酸相互作用机理应用最广泛、操作简单且有效的方法。根据研究方法的不同,可以将紫外光谱法大致分为两种:
2.1
研究金属配合物对DNA紫外光谱的影响
DNA分子含有碱基生色团的双螺旋结构,紫外吸收光谱在
通讯作者:张万举(1981一),男,讲师,主要从事生物无机化学研究。E—mail:w肌juzhang@yahoo.toni.cn
万方数据