域。EML4隶属于棘皮动物微管相关类蛋白家族,包括
WD一重复区、N端Basic区和HELP域。它们都和EMIA-ALK肿瘤生成的潜能有关,且Basic区在EML4一ALK二聚体化的过程中扮演着重要的角色,去除Basic区可使EMIA-ALK融合蛋白的催化活性降低84%,可以推断Basic区可能是EML4-ALK融合蛋白发挥作用的关键区域。
ALKali是胰岛素受体超家族的成员,可与ATIC一、TFG,、CLTC一等多种基因发生融合,其结构包括:胞外配体结合区、跨膜区、胞内酪氨酸激酶区。
EML4与ALK定位于2号染色体短臂上,但两者方向相反,相隔12Mb,融合时须EML4或ALK其中之一反向
与对方连接,EML4-AL蹉因亚型取决于两者断裂相接的
位置,因此EML4断裂点呈现出多变性,目前已检测到的断裂点有2、6、13、14、15、17、18、20号外显子,这些形成了至少11种EML4-ALK95虫,合基因亚型,已有实验【4。1u证实它们中的大部分能促进肿瘤生成。
2
EML4-ALK融,合基因的检测方法检测EML4-ALK融合基因的方法很多,主要包括免疫组织化学、逆转录聚合酶链式反应、荧光原位杂交技术和RACE一偶联PcR测序等,现将常用的检测方法简述如下:
2.1免疫组织化学(immunohistochemistrMIHC)
IHC是
病理检测的主要方法之一。因其操作简便、成本低、工作量较小而被广泛应用于临床和科研工作中,IHC的最大优势是能检测到肿瘤特异性抗原,但不会破坏细胞和组织的结构特征。实验证实IHC同FISH和RT.PCR检测EML4-ALK-融合基因的结果具有一致性,但其敏感性劣于FISH和RT-PCR法,而且不能鉴定ALK融合患者具体来自哪种变体亚型。因此,可以将IHC法作为筛查EML4-ALK融合基因的方法。
2.2逆转录聚合酶链式反应(reverse
transcription.poly—
merasechain
reaction,RT-PCR)RT-PCR法是一种敏感性高
的基因检测方法,可以检测到很低拷贝数的RNA,可能是确认NSCLC存在ALK融合基因的一种快速诊断方法。利用术后或其它方法取得的标本,获得总RNA后进行RT-PCR,X寸PCR产物进一步分析以确定是否含有EML4一ALK融合基因,该法需要高质量的RNA,但石蜡切片中的DNA及RNA在检测过程中会逐渐降解,最终会影响检测结果的准确性,因此,RT-PCR更适用于新鲜组织标本
万方数据
的基因检测。但其缺点在于对引物要求很高;分辨不出
EML4-ALK-融,合基因的未知亚型;假阳性率较高。由于此方法操作复杂,在常规临床诊断实验室可能难于施行。2.3荧光原位杂交(fluorescence
insitu
hybridization,FISH)
FISH法应用探针特异性标记细胞核中ALK断裂点来检测ALK重排,分离的荧光信号提示存在ALK重排。相LLIHC和RT-PCR,FISH法的敏感性和特异性都很高,但并不是万无一失。与PCR不同,FISH不能鉴别出不同的EML4.ALK副2合基因变异体,且其价格昂贵,分离的荧光信号不易解释。目前,ALK靶向药物克里唑替尼(Crizotinib,
PF.02341066)临床前试验中将FISH法作为EML4-ALK融,
合基因的检测方法。
2.4
RACE.偶联PCRN序(RACE.coupled
PCR
sequencing)
张绪超等u21使用该法检测分析ALK基因的融合变异,他们采用cDNA末端快速扩增(PACE)技术结合两轮PCP技术来扩增ALK基因的融合变体,敏感性高,其优点是能检测到EML4与ALK或其它任何基因的融合,测序后还能发现是来自哪一种EML4-ALK变2体的融合。但目前只有张
绪超等u21的研究应用了这种检测技术,还需要更多的研究加以验证。
越来越多的标本进行了EML4一ALK融合基因的检测,其中以RT-PCR法的应用最为广泛,但目前仍无敏感特异的方法用于EML4-ALK-融合基因的检测。未来的发展方向在于寻找有效可行的方法用于准确检测ALK基因融合。
3
EML4-ALK融合基因与NSCLC的临床病理关系
表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR.tyro.
sine
kinase
inhibitor,EGFR-TKI)治疗有效的患者被证实有
其独特的临床病理学特征,如:亚裔、不吸烟、女性、腺癌。决定EGFR-TKI疗效的关键在于EGFR的19、21j9b显
子突变。NSCLC中EML4-AL硎合基因阳性的患者是否也
有其独特的临床病理特征,世界各地的科学家们对此进行了深入的研究。
日本的Inamura等u3。用RT-PCR法检测了363例肺癌患者的病理标本,11N(3%)标本中检出EML4-ALK融合
基因,患者病理分型均为腺癌,进一步研究证实EML4一
AL劂合基因阳性的NSCLC具有以下的特征:腺泡组织
来源,分化更差;常有"ITF.1表达,偶有TP53突变,极少有EGFR及忌ms的突变;更常见于轻度或不吸烟的患者。
香港的wbng等旧3检测了266例原发性肺癌患者的术