代谢网络通量和结构分析--硕士(13)

代谢网络通量和结构分析

代谢鼹终避量和结搀分橱

这样就褥到了整个代谢网络的袋量滤分森。

｛．３．２戏溜孚蕊分橇

当方程数等于寒知遁量数，这｛÷愤糖是～秘擞燕单的憷提，可以确惠唯一螅邂爨转糍，称为确定方程鲢求解；滥腰测数攥大予自出魔个数时，裁是求髂超定方勰；当掰潮数据小于自由度个数时，就是求解不定方程。其中求解不定方程是～个重要方向，在真宴的代谢黼络中，代谢过程镑综复杂，很多生物的代谢网络都比较陵丈ｐｌ，常常悬数露个代谢耪藕邋千个代谢反应，雨通过现祷的实验手段霹毹检测少数几种物蕊的葳应速率，版缛到螅实验数撰远远小于代谢鄹终鲍皇出度，不能剥用求解确定方程驰方法寒求瓣代溅通懿分毒，因此只枣增搬约衷条｛牛对代谢燃终优傀球怨，对伐谢题络德化求解瓣设计Ｒ””，这就不需要额外的动力学信息。但是约束方式也有多种，目标函数的不同会对代激流分布计算产生影响。

基于麴菜分析逐渐显示出域为分析垒亿网络的有用工具，可以敬生仡网络中揭示形成稳定状恋约束瘊蒜的各秽酶之闽最大反应逮攀荧系。基子约寨分糖戆核心毒嚣令方藤：网络处于稳定状态帮物理纯学约东，妇：计鼗学鲤寨，热力学鳃素｛２４ｊ，爨太霞癍遮率约束。计量学约束限制了反应的质摄平衡和能量平衡关系；热力学约束限制了反应方向；最大投应速率定曳了单独酶反应的栽力一芝述这些分析描述生物组织潜在的行为，燕假定在所有给定的环境下，生物体将会达到一个满足物瑷化学约柬的稳定状态。由予在缨脆系绞中靛约裘不瓣完全获强，就《戆存滚多摹孛稳定状态∞Ｊ。冀了谈别一个其骞物臻化学意义瓣稳定状态，忧纯方法裁舞黪予找禽达至《莱一特殊骞稼功能翡佬纯＇基。ＦＢＡ是～个基于约束的模拟方法，它使用生化网络的计量学约荣来实现。

ＦＢＡ缓定代谢嗣络将会达到一个受计量学约束的稳定状态。计量学约柬导致一个非确定的系统；然而，能够产生～个有边界的对所脊通量可行的解答空间。这个可行空间可以遴一步渡撵定的最小最大遴霪或英它的一楚黪理纯攀饿凌掰隈铡。嚣此，通过实现这些终隶，袋褥我稍能够更鸯羹穗确遮褥裂栈｛鲑瓣终酝经演。然鑫这些约束毽§§够被嚣缕的实黢数据所精化。当限定了描述生物体Ｓ＆力的空间，通过设定某～旦标功能质达ｇｑ优化的稳定状态，再对它的网络行为进彳亍研究。模拟结果能被实验所谖朗，然媾用于进一步翰模型构造。最终，通过厦复选代，提炼模裂精度，生成能够预测细胞代谢行为的预测模爨。

１．３．３代谢平衡分耩模鼙

为了更好豹理解ＦＢＡ，分下尼争步骤来解释。然一步；系统皂义