代谢网络通量和结构分析
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红缁熬中39|辟代澎黪,计算出54个檄端躜径,蔡串有36个类型l路径、3个豢登I{路径、5个类楚In路径。建立了舆育生物学慧义的宠熬极端鼹径集;撬如了~蹙极端路径符合“传统的’’生物化学路径。在考虑网路性能的情况下,极端路径能用来解释一些稳建状悉勰题。
谯代落遴量计舞避稔中。Famili{421等发现一个有意义静公式:
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由已知S求解k笈现L是一系剜代谢池,却每个横向爨构成的一个等式中,根嚣~些原则组合代谢物的总量是恒定不变的。对应于极端路径的三种类型t代谢’媳也给出了¥g慰鲍三耪类型。类型A袭示钢级代谢元素守蠖;类墅B表暴龟食勰缀代瓣耱秘次缀代蔼}耪审鏊溺守餐;裳翟C袭示辅驹豳索守恒。
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熙t3。3代谢池的三墨孛攫型
Fig+113.3强r∞掣≯esofthemetabolicpools
以热分概为基础磷究友零空阀定义了耀关代谶渡,把代谢渣擞努瓣戒兰个部分,从蔼胃激疆出代谢溜守憾凰,可叛清雏莆磁守褪美系,熊更辩褥理勰靛游弼路中备组分的相互菇系。
1.3.2纂嚣避链模式每辍端路强}£较
如槊定义n为零空间的维数(线性赫向量数)16啊,m魁极端路径数,k怒基元模型数。褥到辩下关系:
(1)露掇潦黯柽是萋露模型抟子集褥出n≤m≤觏
(2)掘累交按避量不可逆,鄹么re=k:(3)如果交换通量搿逆,褥到撇<<k。