mapmaker_3应用及辅助软件使用

mapmaker_3应用及辅助软件使用

第23卷第3期

1999年5月南　京　林　业　大　学　学　报

JournalofNanjingForestryUniversityVol.23No.3May1999

遗传作图软件应用及辅助软件的研制　　　　何祯祥　林国忠　Ξ

　　　　　　(210037)

摘　要　　　MAPMAKER3.0(forPC)的功能、。介绍了作者开发的MAPMAKER要求的分析数据文件,以及对标记的MDAC。提出了进一步开发中文版新一代遗传作图软件、建立基因组图谱数据库和基于因特网(Internet)的基因组信息检索等设想。

关键词　遗传连锁图谱;软件;应用与开发

中图分类号　S722

TheApplicationofMAPMAKER3.0(forPC)andtheDevelopment

ofaCompanionProgram

HeZhenxiang　LinGuozhong　ShiJisen

(CollegeofForestResourcesandEnvironmentNanjingForestryUniversity　Nanjing　210037)

Abstract　Theresearchonbio-genomeisahotpointduringthoseyearsintheworld.Theconstructingge2neticlinkagemapisoneofthestudies.Duringtheconstructionofthegeneticlinkagemap,whenwegotalotofmoleculardataweshouldusecomputerstohelpustoanalysethem.MAPMAKER3.0(forPC)isoneofthesoftwarestoconstructgeneticlinkagemapbeingusedwidelyinChina.Thegeneralinformation,datastructure,basicmappingcommandsandstepsofMAPMAKER3.0(forPC)forconstructinggeneticlinkagemapandQTLmappingwereintroducedindetailinthisarticle.WealsopointedoutsomeaspectsnoteasyforresearcherstouseMAPMAKER3.0(forPC).AcompanionprogramMDACforresearcherseasytosetuptherawdatafileandprimaryanalysisofmarkersegregationratiowasdeveloped.Thefutureworkfordevelopingnewgeneticmappingsoftware(Chineseversion),constructinggenomemapdatabaseandsearchingbio-genomeinformationviaInternetwerealsoputforward.

Keyw

ord　Geneticlinkagemap;Software;Applicationanddevelopment

近几年来,生物基因组研究的热潮在全球范围内掀起,其中构建各种生物体的遗传连锁图谱成为当今分子遗传学领域的热点之一[1]。在遗传图谱构建过程中,当获得了大量分子标记的数据以后,由于

Ξ收稿日期　1999202218　修改稿收到日期1999204223

　3国家自然科学基金项目(No.3963230)和国家“九五”攻关项目(952011203217203)

　第一作者简介:何祯祥,男,南京林业大学森林资源与环境学院讲师,在职博士生。

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