山师限选课答案
寻找蛋白质之间的相互作用,动态地反映生物体所处的状态。
12,相互作用网络的研究技术等
样品 样品制备 样品分离 蛋白质点提取鉴定 功能确定 生物信息学 图像分析
13,
1)蛋白质组样品制备基本原则
尽可能提高样品溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失
解除蛋白质之间以及与其它生物大分子的相互作用,使蛋白质完全处于变性状态和还原状态 减少对蛋白质以及蛋白质组的人为修饰(假点)
总之:尽可能简单,减少步骤 14. 一、样品制备的前控制
1. 染色方法的选择
采用双向电泳等方法纯化蛋白质,往往需要染色后才能准确获得用于分析鉴定的样品。染色方法
与蛋白质分析的灵敏度高度相关,染色效果十分重要。
2. 污染的控制(角蛋白)在蛋白质组学分析中,常见a-角蛋白的污染,主要来自实验人员的皮肤
屑和头皮屑。也有b-角蛋白的污染,来自实验人员穿着的毛衣。
2)盐分和去污剂
在进行质谱分析前,应特别注意样品中盐分和去污剂等含量对质谱分析的影响。MALDI-MS分析
技术可以耐受一定量的小分子杂质和盐类物质,但样品中含有表面活性剂或其他难溶盐分,则很难产生好的结晶。
二.样品的制备
操作步骤及注意事项:
(1)切胶和脱色
切胶前用ddH2O洗胶2次,每次15min.
用干净的刀片从胶上切取蛋白点,将胶块切成1mm3大小,放入200ml Eppendorf管内。切胶时
尽量不要超出蛋白点的范围,胶块的大小要适当。胶块太小在以后的抽取步骤中可能被吸掉, 太大不利于脱色、酶切、抽取等步骤。