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砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析(8)

发布时间:2021-06-08   来源:未知    
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1386 园 艺 学 报 41卷 续表4

SSR引物 序列 Sequence 编号

No. SSR primer 正向引物 Forward primer(5′–3′) 反向引物 Reverse primer(5′–3′)

17 CMTp263 CAGGCTATTCGCACCCTCTA CCTCATGCATTTTGCGTGTA 5 0.56

18 CMTm5 TTTCTCGAGCCTCAC ATGGACAATTTGGATATTA 5 0.95

19 CMTm11 TGGAAGGATTCTCCCACAGT TACAATTTGACGTCCGCAAG 8 1.18

20 CMTm19 GCATGGGAGATGAAGGTTAG ATTTCCTGGTGGTATGAGATTC 5 0.72

21 CMTm20 GTGGGCCATATCGATTCACT CGAAAGTCGCAGAGAACACA 5 0.79

22 CMTm50 CAGTGTTCCTCTCCCCATTC TCGGACTCTGAACTTGACCA 3 0.43

23 CMTm62 AGTGAGGGAGGCGACAACT GAACGTGTCCATGTCATTGC 3 0.32

24 CMTm63 GCAGAAGATACCGTCGGAGT AAGGTGAACGGGAATGTGAG 8 0.63

25 CMTm66 ACGCGTTGTTGTTAGTGTGG GGGGATTTATGAACCCAACAT 3 0.51

26 CMTm90 TGAAGCATTAAAAATGGGTGTG ACACATTGCCCACTAATTCTAGG 5 0.84

27 CMTm121 CCCAAATTCAAAAGAAAATC CCAGTTAAATCAGACCGAAT 3 0.44

28 CMTm133 CGACGTATGATCGAGCCTCT TGCTAAGCCGTTGTCATCTCT 4 0.60

29 CMTm144 ACATGGGCATACCTCGAATC CACCTGGCTGTTTTGTCTGA 3 0.29

30 CMTm158 CCCAGCTATGAAGGTCTCTG AAAAGCACAAAAGAAACACCA 5 0.82

31 CMTm165 TTCCAGACCCAATTCCCTTA TCCATGGAGATGGGAGGTAG 5 0.97

32 CMTm170 TCAGACCCACTCCCATGAAC AGCGAACACGTGAAAACGTC 5 0.97

33 CMTm181 CCCTTAAGGTCTCGCAGCTT TATTAGGCGGACGGACAGG 2 0.60

34 CMTm183 CTTTGCATTGCCACTCTTCT TGAGGGAAATTGAATGTGGT 4 0.68

35 CMTm209 ATTAGAATCCCTTGGAGAACG GCAATCGTTTTTCTGTTGGT 6 0.59

36 CMTm214 TGCTTTGATCAGTGAGCAGT GGATGTACTCTCCGGACTTTC 4 0.56

37 CMTm221 CAATAAGATAGCTCTCACGTTGC TGCCTAGTTATCGCGACTTC 2 0.43

38 CMTm248 TGATCATGAAAGGGGGAGAG CCACTTCAAGCTTGCCTTCT 4 0.34

39 CMTmC1 AACGTCCTTACTGGCACACC TTCCACAAGTTGTTTTGGTCAC 5 0.85

40 CMTmC30 TCAAACACTTTCTTTGGAAGGA TTTCATTGAACTGGGTCAAGCG 2 0.24 多态带数 多样性指数 Polymorphic fragments H ’

图1 引物CMTm11在47份砧用南瓜材料上的PCR扩增图

Fig. 1 PCR amplification profile in 47 varieties by primer CMTm11 in rootstock-used pumpkins

2.3 聚类分析

依据欧式距离,对47份砧用南瓜种质资源的所有形态学性状进行UPGMA聚类分析,绘制聚

类树状图(图2)。当阈值为1.02时,47份材料划分为4个类群。其中,第Ⅰ类群中包含了大部分 的品种,共有40份种质,占85.11%;类群Ⅱ只有1个品种(34号);第Ⅲ类群中有4个品种,分

别为2、7、30、44号材料;类群Ⅳ中为12和47号材料。类群Ⅰ全部为中国南瓜,类群Ⅱ和Ⅲ为白 籽南瓜,类群Ⅳ为黑籽南瓜。在4个类群中,根据对形态性状的测量和观察(具体数据未列出),类 群Ⅰ种子均无光泽、多数质量较轻,能结实,植株长势中等;类群Ⅱ种子白色、有光泽,能结实, 植株长势较强;类群Ⅲ种子均为白色、有光泽,雄蕊败育,未结实,植株长势较强;类群Ⅳ少雌花, 结实率极低,植株长势前期强后期弱。在3个类型的南瓜中,白籽南瓜(类群Ⅱ、Ⅲ)的植株长势

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