作物学报,农作物,期刊,一级学报,写作
第1期郭涛等:一个控制水稻叶色白化转绿及多分蘖矮杆性状基因hw-l(tffl9鉴定
幼苗取等量新鲜叶片,加液氮研磨,按10mL
g-1加
入预冷(一20。C)酒精/水混合液(5/1,v/v),_4℃过夜萃取。8000xg离心15min使固液相分离,重新萃取不溶性残渣12h。将2次萃取的上清液混合,真空旋转干燥至第二相。加入等体积石油醚,过滤15
min
除去油脂和部分植物色素;重复抽提两次,弃石油醚相。用等体积的乙酸乙酯萃取水相2次,弃水相,真空干燥有机相。残留物溶于5
mL
100%蚁酸,以
多微孔膜(O.45um)过滤。每个样本取20uL注入HPLC仪(LC.20AT,Shimadzu,日本),流速1
mL
min~,以UV检测探头在波长254am下连续监控
20
min。流动相由甲醇,水,乙酸(45/54.4/0.6,v/v/v)
组成。分别将IAA和GA3溶于甲醇/水(4/1,v/v)配成标准液(2mg
mL_1),并稀释成5个不同数量级浓
度。
1.5突变体对温度的敏感性
采用相同光强度、光周期和不同温度(15。C、20℃、25℃、30℃、35"C)在人工气候箱(RXZ.280B,江南,中国)中培养突变体和亲本,观察第1~4叶片颜色变化。
1.6净光合率和叶绿素含量测定
在LED光源下采用便携式光合测定仪(Li.6400,Lincoln,美国)于苗期和拔节期测定突变体和亲本
上二叶的净光合率,检测时间为上午8:30—10:00。其后分别从每个处理取3株材料的新鲜叶片,等量混
合(0.1~0.5g),用95%丙酮抽提48h。采用分光光度
计分别测定抽提液在波长645nm和663am下的OD
值。利用AITIOn掣611的方法计算总叶绿素、叶绿素
a和叶绿素b的含量,每个处理重复3次。
1.7叶绿体超微结构观察
将水稻幼苗不同时期的叶片切成小块(3
mln
x
1
mm),用4%戊二醛溶液固定(含0.1molL_1pH7.3
磷酸缓冲液和l%锇酸)。再以不同浓度乙醇溶液脱
水,环氧树脂812包埋,超微切片机(UCT,Leica,德
国)切片,电子显微镜(Tecnail2,FEI,荷兰)下观察叶绿体超微结构并照相。
1.8
DNA提取及PCR检测
采用CTAB法【32】提取水稻基因组DNA。PCR
扩增体系含2xPCR
Reaction
Mix10pL(含100
mmolL~KCl、20mmol
L-1
Tris—HCl、3mmolL一1
MgCl2、400mmolL~dNTP),TaqDNA聚合酶(5
U
“L-1)0.2pL,引物(10pmolL_1)各1pL,模板DNA
I
uL,超纯水补至20¨L。反应条件为94。C预变性
5
min;94*C变性30S,55*C退火30S,72*C延伸30
S,
35个循环;72*C延伸7min。扩增产物经8.0%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(电泳缓冲液lxTBE,电压75V时间2.5h),0.1%AgN03染色,BIORAD凝胶成像系统观察、照相、读带。
1.9
SSR标记来源及lnDel标记的开发
选择已公布的SSR标记用于突变基因定位,引
物序列来自http://www.gramene.org/。
按照Shen等[33】的方法,在NCBI(http://www.布的核苷酸序列进行BLAST对比,在已定位区间内‘寻找插入缺失5。20bp的序列,根据其上下游序列1.10连锁分析
采用Michelmore等【34】提出的近等基因池分析法筛选突变基因连锁标记。在F2群体中随机挑选10因池间扩增有差异的标记,再用分离后代单株验证找与突变基因紧密连锁标记在水稻基因组(日本晴)
hfa.1叶色受生长发育和温度调控
三叶期之前,突变体hfa.J的第1和第2片叶为
白色,随后逐渐转绿(图1.A—D),三叶期之后,叶片由叶基到顶端,叶脉至叶缘完全转绿,有时新分蘖叶片也为白色,但很快转绿。相反,突变体亲本而hfa..f的白化转绿表型则受温度调控(图1一E~H),当温度为25—30*C时,叶片完全白化,温度介于
15—20*C时,叶片为黄白色。显然,hfa.J的叶片颜色
同时受植株的生长发育和外界的温度调控。
叶绿素缺失导致nya.1叶片白化
为进一步研究突变体的白化转绿表型,分别于
和亲本叶片的叶绿素含量和净光合速率(表1)。结果
ncbi.nlm.nih.gov/)上对粳稻日本晴和籼稻93.11已公设计InDel标记引物。
个突变表型植株和10个正常表型植株,分别取等量DNA混合,构建两个基因池。通过引物筛选寻找基该多态性标记是否真正与目标基因连锁。利用MAPMAKER作图软件构建目标基因区域的连锁图谱。通过Gramene网站(http://www.gramene.org/)查上的位置,构建覆盖目的基因的物理图谱。用禾本
科基因组自动注释系统(http://www.gramene.org/)预测候选区域的基因组序列可能的编码区(ORF)。
2结果与分析
2.1
Francis叶片在不同生长发育时期均为绿色。人工控温条件下,突变体亲本Francis叶色未受温度影响,2.2
水稻二叶期(白化期)和拔节期(转绿期)测定突变体