作物学报,农作物,期刊,一级学报,写作
郭涛等:一个控制水稻叶色白化转绿及多分蘖矮杆性状基因hw-l(t啪鉴定
GA,处理对突变体hfa-I和亲本第2片叶鞘长度的影响
The2ndleafsheathelongationofthemutantya-IandthewildtypewithGAstreatment
表3
29
Table3
表示舔加GA3:—G~表示没有添加GA3。
mean¥GAtreatment;—GA3meanswithoutGA
treatment
个白化单株并用标记RMl7605和RMlll3检测。结果在hw.1(0与RMl7605之间共检测到56个重组,而hw.1(0与RMlll3之间存在11个重组。根据重.组率计算其遗传距离,hw.1(0与2个标记间的距离
分别为1.55cM和0.44cM(图7)。
为了进一步缩小hw.1(0的定位区间,根据粳稻品种日本晴和籼稻品种9311的基因组序列差异,在
RMl7605和RMlll4区间内开发38个InDel标记,
其中7个标记在hfa.j和02428间存在多态性(表5)。连锁分析发现在F2(坷h.1x02428)群体中HW2、
HW21、HWl5、HW3、HW27、HW7与hw一1(0间分
别发生42、30、24、22、9、7和2重组事件,而HW36与hw.1(0间则出现零重组。根据重组结果,最
终将hw.1(0定位在HW27一HW7区间内,遗传距离
圈6蛳1.1和亲本a-淀粉酶诱导实验
lateassayofⅡ amylaseinductiononhfa Iandthe
分别为0.186cM和0.053eM(图7.c)。
2.9
hw-1(0定位区域物理图谱构建
type(wD
b表示舔加GA¨—G~表示投有添加GA3。
wild
fl¥GA
从Gramcne数据库(http://www.gramene.or奶下
载hw.1(0基因所在区域的克隆序列,根据克隆之间
的重叠关系将克隆首尾相连,随后将RMl7605~
RMI
1
treatment;—GA3meanswithoutGAtreatment.
表4F2群体白化和绿叶檀株的分离
60rs
;egregaUonofalbinoandgreenphntsinBpoputa-
14之间的多态性标记与克隆序列整合,9个与
F2群体
F2popala-
正常表型
Normal
突变表型
Mtttant
/ga.j座位紧密连锁的多态性标记锚定在AL606999、
2
些女壁9壁
瑚¨∞
(il)
AL606646、AL606619和AL606652四个克隆上(图
8),其中与hw.j俐两侧距离最近的标记HW27和HW7分别锚定在克隆AL606619的29.2kb和73.1
蚴螂煳蛳蛳哪
啪m詈|
勰瑚帆
kb处。最终将hw一1(0座位界定在HW27和HW7之
间46.9kb的物理距离内,对应于日本晴第4染色体序列(5’_3’)33
902708—33949569
个池间表现出多态的标记进一步检测F2群
bp区间(hup://
邑否与hw.1(0存在连锁关系。结果第4号35个供试SSR标记有2个(RMl7605和在基因池间表现多态性。进一步用和RMlll3检测126个F2白化单株,结果.1(0与RMl7605存在15个重组,而与
存在6个重组。hw.1(0被初步定位在一RMlll3区域内(图7)。
WWW.gramene.org/)。
根据禾本科植物基因组自动注释系统(http://
www.gramene.or90预测该区域的基因组序列,得到13个ORF,其中有8个假定的表达蛋I!t(expressed
pro-
tein),4个功能未知的表达蛋白和1个假想蛋白
(hypotheticalprotein)(表6)。功能注释表明LOC—
Os04957320为假定的IMMI丌ANTS蛋白,immutants
882
细定位hw-1Ⅲ,将F2作图群体增加至1
(拥)作为拟南芥的典型叶色突变体,其显著特征为叶