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作物学报第38卷
Table5
与hw.1(0基因连锁的SSR和InDel标记
PCR basedSSRandInDelmarkerslinkedtohw-1(0
反向引物
Reverse
表5
gene
M池r
RMl7595RMl7605HW2HW21HWl5HW3HW27HW36HW7
RMlll3RM559
标记正向引物
ForwardPrimer(5L3。)
起始位点
Startposmon(bp)a
#增岁段
primer(5f_3’)
裟篙
171194255288169299189860289428169
GGGATCACGGAGCTCAAGTACCATTAAGGGCCTGCTCTGTTCTGCTGTCAGCCATCGTCATCGATCCAAGCCTCCCGTCTGCTCCACCATTCATTTCTACTGTCGCATGGTGAGATAGGAGCAACAGGCGTTAGTCTATGGTATGCTTTTCAGACGGTCGTCGTCCTCTTCTCTTCATCGGTTCTTGGGTTGGTGAGCTTCCAGAGCGATGGGTGTCAGTTTGC
GCTCCTCCCAAACCCAAATCCGTCCACTCCTCTCCCTATCATGCAGCCGTCAGTCAGCAAAGGTCAGGGCTCTTCTGCACTCTACTCCGAGATGCCGTCGTTAGGTGAAGGAGACGGGAAAGATTTCGTGGTCTCATAGGTTGAGACGAGAGTTATACTCCT
GCTAACACCGAAAGAGGCAAAGCTAGGGCGCATGTGTATTTCTTCCCGTACGTACACTTGGCCCTATGC
3346848133680591336925573377763433866129338798923390251933923819339495693408597335151595
4对应的粳稻品种日本晴第4染色体的基因组位置。
8
Thegenomicpositionof
A
chromosome4inricecultivarNipponbare
RM348
RMl7595
RMl7605
RMl113
RM559
Chr.4N=126
Marker
BMarker
RMl7605HW2HW21HWl5HW3HW27HW36HW7
RMlll3
Geneticdistance
1.4881.1160.7970.6380.2390.186:0.053eM0.292
(c№
BAC
56
4230
24
97
02
11
N=1882
C
Physicaldistance
Ge∞似呻
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
Fig.7
利用F2作图群体(hfa.1x02428)定位hw.J㈣基因
Mappingofthehw 1(0geneusingtheF2population(hfa-lx02428)
图7
(A)hw一1(0被初步定位在第4染色体SSR标记RMl7605和RMlll3区间内;(B)hw.1(0被精细定位在第4染色体InDel标记HW27和
HW7区间内;(c)通过GRAMENE数据库预测46.9kb区间内有13个候选基因(表6)。
(A)hw一1(0wasmappedtotheintervalbetweenSSRmarkersRMl7605andRMlll3inchromosome4;(B)hw一1(0wasfinemappedto
intervalbetweenInDelmarkersHW27andHW7inchromosome4;(C)Inthe46.9kbregion,13putativegeneswereannotatedin
GRAMENEdatabase(Table61.
the
片斑驳,即同一片叶出现白化和绿色表型。现已探明与拟南芥IM突变体存在诸多相似,推测LOC—Os04957320最有可能为J}1w.J例的候选基因。
拟南芥眺突变体的斑驳表型由单隐I生基因控制,且受
光强和温度调节‘581。拟南芥砌基因突变除了影响叶片表型外,还对植株的其他性状产生广泛的影响,例如植株变矮,根部延迟生长。考虑到hfa—J的突变表型
3讨论
叶绿素合成通路或叶绿体蛋白转移途径上的任