总RNA的提
仪器和主要试剂:
1. 紫外分光光度计、微量加样枪、灭菌超薄PCR反应管
2. Trizol试剂
3. 氯仿
4. 异丙醇
5. 75℅乙醇
6. 无RNase的水或0.5℅SDS (溶液均需用DEPC处理过的水配制)
实验方法:
(一)RNA提取
1. 匀浆处理:
a.组织 将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml Trizol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过Trizol体积10℅。
b.单层培养细胞 直接在培养板中加入Trizol裂解细胞,每10cm2面积加1ml,用移液器吸打几次。Trizol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。Trizol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
c.细胞悬液 离心收集细胞,每5-10×10动物、植物、酵母细胞或1×10细菌细胞加入1ml Trizol,反复吸打。加Trizol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。
(注意:匀浆一定要彻底,是提取高质量RNA的前提;细胞数量与Trizol的比例,细胞的数量不能过多。)
2. 将匀浆样品在室温(15-30℃)放置5 min,使核酸蛋白复合物完全分离。
3. 可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2-8 ℃ 10000×g离心10 min,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。
4. 每使用1ml Trizol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15s,室温放置3 min。
(注意:此步振荡非常重要,建议在旋涡振荡器上进行。)
5. 2-8℃10000×g离心15 min。样品分为三层:底层为黄色(红或绿)有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用Trizol试剂的60℅。
6. 把水相转移到新管中(如要分离DNA和蛋白质可保留有机相),用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml Trizol加入0.5ml异丙醇,室温放置10 min。
7. 2-8℃10000g离心10 min,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。
8. 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml Trizol至少加1ml 75℅乙醇。2-8℃不超过7500g离心5 min,弃上清。
9. 室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀,不要晾得过干,否则不易溶解,大约晾5-10min。加入25-200 l无RNase的水,-70℃保存。 67