总RNA的提
(二)紫外吸收检测RNA的浓度和纯度
1. 紫外分光光度计先用水在260nm和280nm两个波长下校零。
2. 取RNA样品5μl,用水稀释50~100倍,转入分光光度计的石英比色杯中。
3. 在260nm和280nm分别读出样品OD值。根据260nm时1 OD单位的单链RNA = 40μg/ml和稀释倍数,可以计算出样品RNA的浓度和产量。
4. 若OD260/OD280小于2,说明可能有DNA片段污染,可以考虑用无RNase的DNase处理样品,若小于1.8,说明样品中还可能含有蛋白质或酚,应再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀纯化RNA。
注意事项:
1. 从少量样品(1-10mg组织或10-10细胞)中提取RNA是可加入少许糖原以促进RNA沉淀。例如加1ml Trizol匀浆样品,沉淀RNA前加5-10 g RNase-free糖原。糖原会与RNA一同沉淀出来,糖原浓度不高于4mg/ml是不影响第一链的合成,也不影响PCR反应。
2. 匀浆后加氯仿之前样品可在-60~-70℃保存至少一个月。RNA沉淀可保存在75%酒精中2-8℃一个星期以上或-5--20℃一年以上。
3. 预期产量:1mg组织或1×10细胞提取RNA分别为:
肝和脾6-10 g,肾3-4 g,骨骼肌和脑组织1-1.5 g,胎盘1-4 g,上皮细胞8-15 g,成纤维细胞5-7 g。
4. 蛋白聚糖和多糖污染:
沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml Trizol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8mol/L柠檬酸钠和1.2mol/L NaCl)混合离心,按之前操作进行。这种方法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,高效沉淀出纯RNA。从含有大量多糖的植物中提取RNA时应在匀浆后离心,并加上以上操作步骤。
5. 预防RNase污染措施:
1)
2)
3) 经常更换新手套,皮肤上常带有的细菌,霉菌可能成为RNase的来源。 使用灭过菌的RNA专用塑料制品避免交叉污染。 RNA在Trizol试剂中时不会被RNase污染,但提取后继续处理过程中应使用不含624RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料制品可在0.5mol/L NaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,高压灭菌,即可去除RNase。
4)
RNA的提取常见问题分析
问 题
得率低
A260/A280<
1.65 解 析 配制溶液应使用无RNase的水(将水加入处理过不含RNase的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.01℅v/v,放置过夜,高压灭菌。注:DEPC有致癌之嫌,需小心操作。 A.样品裂解或匀浆处理不彻底 B.RNA沉淀未完全溶解 A.检测吸光度时,RNA样品没有溶于水,而溶于了TE中