总RNA的提
3.特异性引物:最特异的引发方法是用含目标RNA的互补序列的寡核苷酸作为引物,若PCR反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由与mRNA 3’端最靠近的配对引物起始。用此类引物仅产生所需要的cDNA,导致更为特异的PCR扩增。
仪器和主要试剂:
1. 基因扩增仪(如PE GeneAmp PCR System 2400 或 9700)、微量加样枪、灭菌超薄PCR反应管
2.RNA提取试剂
3.第一链cDNA合成试剂盒
4.dNTP mix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2 mmol/L
5.Taq DNA聚合酶
实验方法:
1. 总RNA的提取:见前述内容。
2. cDNA第一链的合成:目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以TAKARA公司提供的PrimeScriptTM 1st Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒为例。
(1)在0.2ml微量离心管中,加入以下:
总RNA 1-5 g
dNTP 1 l
Random primer 1 l
补充适量的DEPC H2O使总体积达10 l。轻轻混匀、离心。
(2)PCR仪上65℃加热5min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。
(3)然后加入下列试剂的混合物:
5×PrimeScript buffer 4 μl
RNase inhibator 0.5 μl
RTase 1 μl
RNase free H2O 4.5 μl
轻轻混匀,离心.
(4) 30℃孵育10 min。
(5) 42℃孵育60 min。
(6)于70℃加热15 min以终止反应,将管插入冰中。
3.PCR:
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:
第一链cDNA 2 μl
上游引物(10pmol/L) 2 μl
下游引物(10pmol/L) 2 μl
dNTP(2mmol/L) 4 μl
10×PCR buffer 5 μl