Primer Premier 5.0中文使用说明书(7)

Primer Premier 5.0中文使用说明书

z GeneTank

利用GeneTank您可以打开DNA

或者蛋白质序列

也可以选择不同的阅读框架

共三种将DNA翻译成蛋白质或利用蛋白序列反推出DNA序列

为方便使用软件已经提供了普通密码子列表和几种线粒体密码子列表您也可以输入您自己的其他线粒体密码子列表序列编辑器提供了包括多媒体语言校读在内的完整的序列编辑功能这一功能板块包括以下部分GeneTank打开浏览编辑及翻译序列Translation将打开的序列翻译或反推成其他序列Edit Codon Table编辑翻译所依据的密码子列表

GeneTank窗口

GeneTank的窗口用来显示序列及其文件题头信息序列可以3碱基10碱基一组显示您可以将打开的序列翻译或反推成其他序列您也可以使用通常的拷贝剪切和粘贴命令编辑当前序列GeneTank的窗口上也有启用PrimerAlignEnzymeMotif功能板块的快捷键查看序列

点击相应按钮或从View

菜单中选择您可以查看文件题头改变

5末端序列起始位置选择3碱基或10碱基一组的显示方式

文件题头是指存在于序列文件中位于序列信息上游的文字内容点击header按钮或从View菜单中选择可以显示文件题头信息改变

5末端序列起始位置默认为1序列将从您指定的5位置开始显示序列可选操作

View >Show Header

View >GroupingView > 5’ Seq No 某些版本没有这一项

打开已有序列

使用菜单File >Open可以激活文件选择对话框

文件用来打开您希望处理的包含特定序列的

如果序列文件是GenBank的标准格式PRIMER PREMIER会自动识别打开文件中的序列起始位置或是您曾经使用本软件菜单中File > Save命令以PRIMER PREMIER默认格式保存过该文件序列将自动打开如果打开其他格式的序列文件将出现一个可卷动的Import Sequence

窗口并显示全部序列

在序列第一行的起始处双击则双击处以前的所有信息将被认为是文件题头然后PRIMER PREMIER会自动剔除非序列字符并将序列在GeneTank里打开

创建新序列该项功能可以让您手动键入一个新的序列您可以键入任何DNA或蛋白序列并存在您指定的文件夹内并可以象其他如GenBank

格式的文件一样进行操作